1.規(guī)劃不合理，管理不善

目前我國部分農(nóng)田水利工程建設存在盲目性、隨意性的現(xiàn)象，由于沒有科學的規(guī)劃作為指導，導致農(nóng)田水利工程建設過程中在工程技術、合理開發(fā)與經(jīng)濟效益等諸多方面不能相互兼顧，加之工程實施時各自為政，很難統(tǒng)一目標。同時，由于過去這些小型水利工程是由農(nóng)村集體統(tǒng)一使用和管理的，而后來經(jīng)過改革，農(nóng)村的集體管理意識已越來越淡薄，造成建管脫節(jié)、管理被忽視的局面。而農(nóng)田水利工程管理主體不明確，逐漸形成了農(nóng)民不能管農(nóng)田水利基礎設施，而集體又管不好，國家也管不到的尷尬局面，農(nóng)民沒有在使用水利基礎設施的時候沒有自覺維護的意識，把它視為公共財物，不能意識到其與自身農(nóng)業(yè)生產(chǎn)是息息相關的，從而參與工程的維護管理不積極、不主動，甚至會出現(xiàn)損壞農(nóng)田水利設施的現(xiàn)象。在長期有人用、沒人管的情況下，水利工程難免出現(xiàn)問題，影響農(nóng)業(yè)生產(chǎn)效益。

2.工程質(zhì)量不過關

農(nóng)村水利工程因為項目規(guī)模小、分散性大，歸屬于地方農(nóng)村集體，而不能得到足夠的重視，往往建設過程中的配套設施不夠完善，施工方法也不夠科學經(jīng)常出現(xiàn)質(zhì)量問題，甚至很多時候是由農(nóng)民進行施工，施工單位自身就沒有質(zhì)量意識，建設標準很難達標，缺乏專門從事質(zhì)量監(jiān)督的人員。而工程建成后因為大多不是專業(yè)人員而是由農(nóng)民來維護，也很難達到正規(guī)的水利工程維護水平。導致農(nóng)田水利工程建設質(zhì)量不過關，影響使用壽命與綜合效益。

3.分包的情況嚴重

通常建設項目的合同中都明文規(guī)定不允許分包與轉(zhuǎn)包，然而事實情況是這種分包與“隱性轉(zhuǎn)包”的現(xiàn)象并不少見，且大多分包商都沒有經(jīng)過嚴格的資質(zhì)審查。很多單位只是借用經(jīng)過資質(zhì)審核的施工單位進行投標，而這些借出資質(zhì)的單位往往不參與施工的管理，只是收取中間管理費。最后，施工任務經(jīng)過層層分包由非專業(yè)隊伍承擔。

4.工程建設標準低

由于受技術、資金、物資等多方面條件的限制，許多工程建設標準低，如灌溉山塘存在壩坡保護設施差、壩身單薄、穩(wěn)定性差、未設置排水設施等；壩體和壩基滲漏問題普遍：啟閉不靈，涵管老化；溢洪道不標準。渠系不配套，大部分干渠利用河道代替，有些田間渠道還是泥渠，渠道滲漏水現(xiàn)象嚴重，渠系過水能力低，排灌能力弱等，效益問題突出。

5.建設資金不穩(wěn)定

通常農(nóng)田水利工程的建設都是由投資者自籌或社會投資，只有少量應急工程是由政府投資的。由政府部門投資的往往投入資金較少，而自籌資金雖然比較靈活，但資金鏈不穩(wěn)定，經(jīng)常出現(xiàn)因為資金短缺而出工程停頓的情況。如果資金渠道不順暢，極易導致建設質(zhì)量不達標，降低工程的使用價值，影響后期維護情況。而目前的現(xiàn)實是除了應急的抗旱打井與“民辦公助”等少量工程建設有政府提供資金，大多建設項目都沒有政府投入，建設以及后期維修養(yǎng)護基本上只能依靠項目受益人自籌資金解決。而由經(jīng)濟條件較差的農(nóng)民來自籌難度又較大，建設資金很難及時到位，資金投入過少，又使得建設標準降低，造成惡性循環(huán)。